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2014 源宜基因秋季生物信息数据分析培训班巡讲正式开启
作者: 来源:源泉宜科 发布于:2014-9-13 14:54:47 点击量:

 

       源宜基因专注于分子生物学技术服务,经过多年的发展,在文库构建技术、生物信息数据分析、深度测序技术、生物芯片技术、甲基化检测技术、SNP检测技术、miRNA检测技术、实时定量PCR检测技术方面形成了深厚的技术储备,并独具自身特色,通过优质服务赢得了广大客户的广泛好评。

2014源宜基因秋季巡讲     农林专场主题

专题一:生物信息数据分析

平台的构建9:30-10:30)理论+上机

 

1. Linux在生物信息中的应用

2. 生物信息分析中常用的Linux命令

     用户权限介绍

     软连接和硬链接介绍

     环境变量配置介绍

3. 生物信息分析平台的初步建立

4. 生物信息云平台介绍及使用方法

5.生物信息基本技能

6. Linux Shell编程入门

专题二:转录组数据分析解读

及实例操作11:00-12:30)理论+上机

 

1. 介绍转录组数据分析的整体流程:包括de novo转录组分析、有基因组reference的转录组分析、microRNA分析等。

2. 转录组分析经验交流:包括测序量如何选择;测序质量如何评估;如何根据自己的实际情况选择mapping/denovo assembly软件;如何从转录组数据寻找生物学问题。

3. 基于二代RNA-seq的差异基因分析(参照序列):

主要利用tophatcufflinks,cuffdiff以及cummeRbund等工具,实现readsmapping, 转录本的重构,转录本的表达量计算,差异基因分析以及利用cummeRbund图形化展示cuffdiff的分析结果。GOKEGG富集等功能分析。

专题三:基因组学数据分析解读

及实例操作13:30-16:00)理论+上机

 

1. 分析工具介绍

2. 平台数据介绍

3. 基因组常规分析和深度分析

4. 全基因组/外显子组测序分析介绍

5. 通过对NGS工具的安装、配置、运行来熟悉Linux环境下的生物信息分析软件;

6. 重测序的分析流程;

原始测序数据的质控及过滤估、拼接组装、SNPCalling等分析过程;FastQCBWASamtools等工具的使用;

 

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2014源宜基因秋季巡讲     医学专场主题

专题一:生物信息在临床研究中

的应用9:30-12:30理论+上机

 

1. 疾病的特征分类

2. 单基因疾病的研究方法

3. 基于组学的复杂疾病研究

4. 生物信息数据库在临床医学中的应用

专题二:高通量测序在临床研究中

的案例分析13:30-16:30)理论+上机

 

1. 高通量测序的特点与优势

2. NGS技术在癌症基因组研究中的应用

3. NGS技术在癌症转录组研究中的应用

4. 复杂疾病GWAS研究

 

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如需报名,请向辖区技术服务专员索要《报名回执》或者在公司网站页面点击下载回执表文件下载,填好表发邮箱service@yqykbiotech.com!谢谢!

 

 

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